Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms