Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt16Q9Z2K1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt16Q9Z2K1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms