Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Robo3Q9Z2I4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Robo3Q9Z2I4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Robo3Q9Z2I4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Robo3Q9Z2I4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Robo3Q9Z2I4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Robo3Q9Z2I4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Robo3Q9Z2I4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Robo3Q9Z2I4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Robo3Q9Z2I4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Robo3Q9Z2I4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Robo3Q9Z2I4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Robo3Q9Z2I4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Robo3Q9Z2I4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Robo3Q9Z2I4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms