Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms