Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp1Q9Z273 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms