Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms