Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms