Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema4fQ9Z123 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms