Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms