Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp2Q9Z0E6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms