Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stxbp4Q9WV89 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms