Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms