Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms