Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Lhx9Q9WUH2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Lhx9Q9WUH2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Lhx9Q9WUH2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Lhx9Q9WUH2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lhx9Q9WUH2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lhx9Q9WUH2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lhx9Q9WUH2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lhx9Q9WUH2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lhx9Q9WUH2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx9Q9WUH2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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