Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc2Q9R244 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms