Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms