Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms