Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms