Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NrkQ9R0G8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms