Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms