Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lamc3Q9R0B6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lamc3Q9R0B6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Lamc3Q9R0B6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lamc3Q9R0B6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms