Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms