Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc1Q9QZF2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms