Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms