Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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ChmlQ9QZD5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ChmlQ9QZD5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ChmlQ9QZD5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ChmlQ9QZD5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ChmlQ9QZD5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ChmlQ9QZD5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ChmlQ9QZD5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ChmlQ9QZD5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ChmlQ9QZD5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms