Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Tnnt3Q9QZ47 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Tnnt3Q9QZ47 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Tnnt3Q9QZ47 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Tnnt3Q9QZ47 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Tnnt3Q9QZ47 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Tnnt3Q9QZ47 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Tnnt3Q9QZ47 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Tnnt3Q9QZ47 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Tnnt3Q9QZ47 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt3Q9QZ47 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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