Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms