Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp3Q9QY23 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms