Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms