Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms