Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN0

Shroom3, Protein Shroom3, mousemouse

Predictions only

Length 1,986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom3Q9QXN0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shroom3Q9QXN0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms