Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacl1Q9QXE0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacl1Q9QXE0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacl1Q9QXE0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacl1Q9QXE0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacl1Q9QXE0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacl1Q9QXE0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacl1Q9QXE0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacl1Q9QXE0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacl1Q9QXE0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms