Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lsm4Q9QXA5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms