Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Trpc5Q9QX29 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trpc5Q9QX29 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trpc5Q9QX29 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trpc5Q9QX29 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trpc5Q9QX29 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trpc5Q9QX29 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trpc5Q9QX29 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trpc5Q9QX29 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trpc5Q9QX29 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trpc5Q9QX29 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trpc5Q9QX29 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trpc5Q9QX29 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trpc5Q9QX29 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trpc5Q9QX29 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trpc5Q9QX29 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trpc5Q9QX29 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trpc5Q9QX29 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms