Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms