Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms