Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms