Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cln8Q9QUK3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms