Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms