Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Hdgfl3Q9JMG7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Hdgfl3Q9JMG7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Hdgfl3Q9JMG7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Hdgfl3Q9JMG7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Hdgfl3Q9JMG7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Hdgfl3Q9JMG7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Hdgfl3Q9JMG7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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