Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg4Q9JM99 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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