Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrfQ9JM73 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms