Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thsd1Q9JM61 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thsd1Q9JM61 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thsd1Q9JM61 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thsd1Q9JM61 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thsd1Q9JM61 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thsd1Q9JM61 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thsd1Q9JM61 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Thsd1Q9JM61 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thsd1Q9JM61 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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