Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms