Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsmQ9JL96 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms