Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms