Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms