Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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