Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms