Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nova1Q9JKN6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms